Outils numériques pour l’archéologie
Introduction & généralités
Introduction
- Objectif
- Définitions
Types de variables
- Séries statistiques à caractère qualitatif
- Séries statistiques à caractère quantitatif discret
- Séries statistiques à caractère quantitatif continu
Tables et méthodes graphiques
- Distribution de fréquences
- Diagrammes en bâtons / circulaires
- Histogrammes
- Polygones de fréquences cumulées
Statistiques descriptives
- Mesures de la tendance centrale
- Mesures de la dispersion
Variables aléatoires et loi de probabilité
Variables aléatoires discrètes
Variables aléatoires continues
La loi normale
- Expression de la loi normale
- Loi normale centrée réduite
- Fonction de répartition
- Propriétés
Estimation d’un paramètre & notion de test statistique
Estimation ponctuelle – estimation par intervalle
- Estimation ponctuelle d’une moyenne
- Intervalle de confiance de la moyenne (cas des grands échantillons)
- Intervalle de confiance de la moyenne (cas des petits échantillons)
- Intervalle de confiance d’une proportion
Premiers tests statistiques
- Théorie de la statistique de la décision
- Comparaison de la moyenne de grands échantillons
- Comparaison d’une moyenne empirique à une moyenne théorique (grands et petits échantillons)
- Comparaison de deux fréquences expérimentales
- Comparaison de deux variances
Tests non-paramétriques
- Généralités
- Test de signe
- Test U de Mann-Whitney
- Test de Wilcoxon
- Test de Kolmogorov-Smirnov
- Test du Khi2
Le matériel
Introduction et généralités: Le cours en ppt
Variables aléatoires et lois de probabilité: Le cours en ppt
Estimation d’un paramètre et tests: Le cours en ppt
Le chi2: Le cours en ppt
Ressources et liens
Dès la première séance de TP, les logiciels R et RStudio seront installés (dans cet ordre) sur vos machines personnelles. La vidéo ci-dessous décrit brièvement les principales étapes de l’installation (en cas de besoin), mais aussi l’interface de RStudio .
Le logiciel R
Le logiciel RStudio
Une vidéo en cas de problème durant l’installation : https://youtu.be/orjLGFmx6l4
R pour les statophobes par Denis Poinsot (lien ou pdf).
Statistiques pour les statophobes par Denis Poinsot (lien ou pdf).
Aide-mémoire de statistiques appliquées à la biologie (lien ou pdf)
Statistiques avec R. Un site très bien fait sur l’utilisation de R, illustré par de nombreux exemples (ici).
Un poly étudiant pour les biologistes- Estimation et intervalle de confiance
Un poly étudiant pour les biologistes – Principe d’un test statistique
Bibliographie générale
De très nombreux manuels de statistiques existent. Dans la mesure du possible, privilégiez les livres écrits pour les biologistes, qui sont souvent plus digestes que ceux publiés pour les mathématiciens.
Probabilités et statistiques, Françoise Couty, Jean Derbord, Daniel Fredon, Relié: 208 pages, Editeur : Dunod, Langue : Français
Bien fait. Des rappels de cours et de nombreux exercices corrigés. couvre le programme de L1 et L2. On peut le trouver facilement d’occasion.
Premiers pas en statistiques, Yadolah Dodge, Relié: 427 pages, Editeur : Springer, Langue : Français
Bon manuel, Couvre l’essentiel du programme de L1 et L2.
Statistiques, Larry Stephens, Relié: 538 pages, Editeur : Série Schaum, Langue : Français
Bon manuel, Couvre l’essentiel du programme de L1 et L2. Se trouve facilement d’occasion
Biostatistique pour les sciences de la vie et de la santé, Marc Trola, Relié: 745 pages, Editeur : Pearson Education, Langue : Français
Très bon manuel, Couvre l’essentiel du programme de L1 et L2.